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新加坡国立大学张洛欣教授作“A Scalable Algorithm for Inferring Phylogenetic Networks from Trees”报告

发布日期:2023-12-26 发表者:陈治国 浏览次数:




   (图文|信息 编辑|信息 审核|刘世超、李国亮)12月25日下午,学院“Happy Hour”年度第26期学术交流会在一综B113会议室举行。新加坡国立大学张洛欣教授为欧亿体育师生作了题为“A Scalable Algorithm for Inferring Phylogenetic Networks from Trees”的专题报告。张洛欣教授在加拿大滑铁卢大学获计算机博士学位,现为新加坡国立大学数学系教授、博士生导师。主要研究方向为计算生物学、离散应用数学和理论计算机科学,在生物序列进化分析理论和算法方面发表上百篇论文,2005年获国家自然科学基金委B类杰出青年基金,1997年获新加坡李光耀博士后研究奖。


   报告中张洛欣教授介绍了一种通过对齐谱系分类单元字符串从进化树推断系统发育网络的快速且可扩展方法,主要用于解决重建系统发育网络这个在系统发育学和基因组进化中重要且具有挑战性的问题。该工作提出一个可扩展的计算机算法,用于从多个基因树推断树-子代网络,方法是通过对齐系统发育树中的谱系分类单元字符串来推断最小的树-子代网络。该算法能够克服现有系统发育网络推断程序的局限性,并且速度足够快,可以在平均约一刻钟内为一组多达50个系统发育树的50个分类单元推断出一个具有大量网状结构的树-子代网络。



   报告结束,张洛欣教授与师生进行深入讨论,大家感觉受益匪浅。本次“Happy Hour”学术交流会在愉悦氛围中结束。

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